当前，我国的医药市场正处于改革发展的关键时期，国内医药贸易企业将面临着外国医药贸易至公司的挑战。在危机与机会共存的今天，迫切需要寻找一种既适合国内医药市场特点又具有先进的治理理念的新的医药贸易企业运作模式。
我国医药贸易运作模式分析
计划经济的分级批发模式
计划经济时期药品流通基本上属于国有专营，全国医药商品产销计划需要衔接、平衡。药品按照国家计划生产，统购统销，价格上实行同一控制，分级治理。由中国医药公司同一规划，一、二、三级批发层层下达指标，层层挑唆。进口药品同一把握，由一级进口后，层层分配。
这种模式把药品作为一种特殊的商品专营，固然规范了医药市场，为我国药品流通的有序发展打下了基础，但这种模式的时代局限性和发展弊端是：一级站都设在东部地区，对西部地区的辐射力度不够。西部地区缺医少药，人民的健康难以得到保障。这种4级批发模式造成了药品流通效率低下，流通速度慢本钱高，导致药品价格增高。所有药品全由国家专营，导致医药流通行业内缺乏竞争，不利于医药流通业的发展。这一医药流通模式现在基本上不复存在，但其对国有医药贸易企业的影响深远。
改革开放以来的多渠道模式
我国的医药流通领域的市场化改革，打破了医药流通业的国家专营的局面。引进了集体、民营等所有权医药贸易企业，加速了医药流通领域的竞争。
目前存在的渠道主要有：药品生产企业→药品零售企业→消费者；药品生产企业→药品批发企业→医院药房→临床医师→患者（消费者）；药品生产企业→药品零售连锁企业→药品连锁企业门店→消费者；药品生产企业→医院药房→临床医师→患者（消费者）等。
这种多渠道模式存在的题目是：药厂生产的产品到终极的消费，往往有6至7个流通环节，结果造成无序竞争、过度竞争现象严重。 从商流的角度看，药品出厂后大多需经过批发企业、零售（连锁）企业或医院药房等多个环节才能到达消费者，多次商品所有权的'转移势必要影响到药品的流通速度，同时也增加了药品的流通用度，造成药品价格过高。从物流角度分析，这就是导致我国医药贸易流通质量低下、流通用度过高的根本原因。
现代医药物流运作模式
以现代医药物流运作体系为基础，在完全符合GSP条件的条件下，在高效利用人力资源的基础上，借助现代化信息技术，不断更新改造治理信息系统，实现药品编码治理，药品批号治理，药品补货治理等现代化物流治理思想，达到了物流运作本钱最低，效率最高，投资最少的目标治理模式。例如，湖北九州通医药有限公司是一家专营各类中药饮片、中成药、化学原料药、中药材、化学药制剂、抗生素、生物药品、生化药品、诊断药品、保健品、医疗器械的大型医药批发企业。该企业以现代医药物流运作体系为基础模式，操纵方式如下：
药品采购：公司设有独立的市场采购部，该部分将药品的采购按药品的剂型划分。根据药品生产企业主要产品的剂型划回不同的采购员负责。在采购过程中要求所有厂家的相关资质和药品的相关资质材料齐全。采购员要对所采购的药品有充分的了解，确保药品质量。
药品仓储治理：采购的药品在进库前，质量检验部分检验药品质量、药品的相关材料和生产企业的资质等资料。药品库存治理按剂型划分，根据不同剂型的药品的保存特点，划区域设立负责人，使责任落实到具体的人。实施药品编码，通过计算机网络将药品编码与商品编码相同一。
